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正文:
基因組測(cè)序,基因組DNA首先都要通過(guò)酶切成片段
通過(guò)基因組序列可以知道一個(gè)完整基因組結(jié)構(gòu)。然而一個(gè)基因組有
幾百萬(wàn)的堿基序列,因此要解決這一問(wèn)題就需要應(yīng)用微
生物學(xué),統(tǒng)
計(jì)學(xué),生物信息學(xué)等多種方法。
基因組測(cè)序有兩種方法,基因組DNA首先都要通過(guò)酶(限制性?xún)?nèi)
切酶)或物理方法(如超聲波)切成片段。
方法一:分級(jí)歸類(lèi)測(cè)序,測(cè)序前分級(jí)歸類(lèi),每類(lèi)都由分類(lèi)的基
因組片段組成。
方法二:也叫全基因組鳥(niǎo)槍法,是跳過(guò)最初的歸類(lèi)分組實(shí)驗(yàn)階
段,而直接測(cè)序任意組的DNA片段,然后通過(guò)生物信息學(xué)方法,針
對(duì)這些DNA片段之間共同的重疊序列,來(lái)拼接并重新排出各個(gè)已測(cè)
序的DNA片段在基因組中的位序。方法一:分級(jí)歸類(lèi)測(cè)序
提取DNA后,將其切成片段,一般通過(guò)超聲波法,切成可操作
的單元(如:用大的載體可以被克隆的片段)50~200 kb,在載體中
將其克隆,如細(xì)菌人工染色體(BACs,見(jiàn)圖解8);克隆的數(shù)量一定
要大,即達(dá)到總基因量的5~10倍。這些克隆的基因組片段然后通
過(guò)特定探針(分子標(biāo)記)雜交或限制性?xún)?nèi)切圖譜分析或BAC末端(500
~600 bp)雜交和測(cè)序后排序,在這些克隆片段(基因組片段)被排
序后,選取單個(gè)克隆再打斷成短的,可測(cè)序片段,然后由統(tǒng)計(jì)學(xué)方
法來(lái)拼接和排列成基因組序列(比對(duì)排列)。
出自http://www.bjsgyq.com/
北京顯微鏡百科
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